特点
简单易用
EasySAXS 的图形用户界面有助于极其方便有效地访问所有软件功能和参数设置。实验性 SAXS 数据和分析结果在两个图形窗格中显示。
可以采用不同的方式来显示数据,例如使用 lin/log 或 log/log 刻度,或者在 Guinier、Porod 或 Kratky 图中显示。消息窗格提供了关于计算进度的通知,并在必要时显示提示和警告。
所有数据分析步骤都可以存储在一个项目文件中,包括所有详细信息。这样就能在稍后某个时间点恢复您的分析,或者将分析方案共享给其他人。所有数据都可以在需要时导出,以供进一步处理或使用其他软件显示。
SAXS 数据分析选项
EasySAXS 软件包含一个全面的工具箱,可支持完整的 SAXS 数据分析链。
- 初步数据处理,例如背景扣除和模糊消除
- 通过 Guinier 分析获取旋转半径
- 纳米颗粒粒度分布
- 通过对分布函数分析获取颗粒形状
- 通过 Porod 分析获取表面区域
- 散射常量和 Porod 体积
- 适用于各种颗粒形状和结构的模型拟合和仿真
- USAXS 数据分析
可以在软件的对象检查窗格中方便地设置分析参数。
可以导出数据并使用公开发布的 SAXS 软件包进行进步的深入分析,例如 ATSAS、Irena 和 SASfit。
自动化和报告功能
通过使用 EasySAXS 的自动模式,初学者和经验不足的用户也可以快速入门。它允许应用包含预定义参数设置的分析模板,对多个数据文件自动执行颗粒粒度和孔径分布分析。分析结果随后在可自定义的分析报告中汇总,并导出为 ASCII 文件。
EasySAXS 附带了各种分析模板,适用于不同的样品类型。用户还可以根据具体的样品要求创建自己的模板。
帮助系统
EasySAXS 包含一个全面的上下文相关帮助系统。它包括所有任务的逐步说明、参数描述、理论背景信息、科学文献引用,还有一些工作实例。另外还提供了《快速入门指南》,可帮助您探索在自动化和交互模式下使用本软件的概念。
与 EMBL 的世界级科学家开展合作
EasySAXS 中使用的某些算法源自于知名的 ATSAS 软件套件,由 Dmitri Svergun 博士和他的团队在位于德国汉堡的欧洲分子生物学实验室 (EMBL) 开发。这些算法包括成对距离分布函数和粒度分布分析,它们是通过间接的傅里叶变换计算实现的。
ATSAS 是一款常用的程序套件,适用于对生物大分子的窄角散射数据进行分析。利用 ScatterX78 从稀释蛋白质溶液采集的实验性 SAXS 数据可通过 EasySAXS 进行预处理,然后导出至 ATSAS 进行深入分析,例如,执行从头计算蛋白质形状重构。
规格
整个软件包
EasySAXS 软件包提供了《快速入门指南》和详细的电子帮助功能。它还包含用于对实验性数据进行自动批处理的分析模板,以及用于进行练习的实例文件。EasySAXS 在 Windows 7、Windows 8.1(64 位)和 Windows 10(64 位)下运行。
当前版本: 2.2